新版标准对最短审核持续时间进行了变更，以确保能够对新的附加要求进行充分审核。现场审核的最短持续时间为2人日，同时FSSC还要求为审核准备时间至少分配0.25人日，为报告编写至少分配1人日。

从2024年4月1日开始，过渡期为12个月，在此日期之前应依照V5.1版进行审核，在此日期之后将不得进行V5.1版本的审核。

升版审核可以在监督审核或换证审核时进行，也可以在常规不通知审核的情况下进行。

由于升版审核将依据FSSC V6版进行，所以在升版审核之前应提供一份认证合同，以告知当次升版审核和现有认证周期中余下审核的审核时间。